Die verschiedenen Jugendparlamente sind teils ähnlich organisiert. Jugendparlamente werden durch einen Vorstand oder ein Präsidium geführt.
Neben dem Plenum, in dem die Mitglieder über die wichtigsten Geschäfte, Projekte, politische Stellungnahmen und Anträge an die Behörden entscheiden und der Vorstand gewählt wird, gibt es projektorientierte Arbeitsgruppen und Kommissionen. Ein Plenum kann ein- oder mehrmals jährlich stattfinden. Die Entscheidung und die Organisation liegt beim Jupa, wobei der DSJ es dabei unterstützen kann.